DNA Sudoku: Logika dari Teka-Teki Matematika "Sudoku" yang digunakan untuk Meningkatkan Kemampuan Rangkaian Genome

Sebuah Matematika berbasis permainan yang menyenangkan dan teka-teki mungkin sekarang digunakan untuk merevolusionerkan perubahan yang cepat dunia dari rangkaian genome dan bidang genetika medis. Hal ini ditunjukkan melalui laporan baru yang disarankan oleh tim yang terdiri dari para ilmuwan di Laboratorium Cold Spring Harbor (CSHL). Laporan ini akan diterbitkan sebagai cover story pada awal Juli yang merupakan isu dari jurnal Penelitian Genome.

Dengan menggabungkan Teorema Matematika Cina yang berusia 2000 tahun dengan konsep kriptologi, para ilmuwan CSHL telah merancang DNA Sudoku. Strategi ini memungkinkan untuk puluhan ribu sampel DNA yang digabungkan dan urutan-urutan di mana huruf abjad dari DNA (A, T, G, dan C) berderet di dalam genome untuk ditentukan sekaligus.

Hal ini signifikan untuk meningkatkan pendekatan yang ada pada saat ini, yang terbaik, dapat menggabungkan ratusan sampel untuk rangkaian.

Keuntungan dari DNA Sudoku
(singkat saja)
Pencampuran secara bersama-sama dan rangkaian yang serentak dari jumlah besar sampel DNA dikenal sebagai "multiplexing". Dalam pendekatan multiplexing sebelumnya, pertama-tama, ilmuwan merangkaikan setiap sampel dengan barcode. Setelah campuran sampel telah dirangkai, para ilmuwan dapat menggunakan tag barcode pada hasil-hasil rangkaian sebagai tanda identifikasi kemudian mengindikasikan rangkaian mana yang menjadi milik sampel tersebut.

Metode yang dipatenkan oleh tim CSHL ini, paling cocok untuk analisis genotip yang membutuhkan segmen singkat saja dari seorang individu yang genome-nya dirangkaikan untuk mengetahui apakah individu tersebut sedang membawa varian tertentu dari plasma pembawa sifat keturunan atau mutasi langka.